公司缴纳五险一金是从工资里扣的，但是只扣一部分。五险一金是由公司和员工共同缴纳的，而公司需要承担的保费缴纳部分相对来说会更多，比如某地区养老保险是公司缴纳19%，个人缴纳8%，失业保险由单位缴纳0.8%，个人缴纳0.2%，生育保险单位缴纳0.8%，工伤保险单位缴纳0.5%，医保单位缴纳10%，个人缴纳2%+3，住房公积金单位和个人分别缴纳12%。
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1、法律分析：个人缴纳部分从工资扣除，单位交的不从工资里面扣。单位和个人扣的公积金,都将转入到个人账户中,可以通过公积金联名查询。住房公积金制度实际上是一种住房保障制度,是住房分配货币化的一种形式。住房公积金制度是国家法律规定的重要的住房社会保障制度,具有强制性、互助性、保障性。
2、法律依据：《住房公积金管理条例》
3、第五条住房公积金应当用于职工购买、建造、翻建、大修自住住房，任何单位和个人不得挪作他用。
4、第十六条职工住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以职工住房公积金缴存比例。
5、单位为职工缴存的住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以单位住房公积金缴存比例。
6、第二十四条职工有下列情形之一的，可以提取职工住房公积金账户内的存储余额：
7、（一）购买、建造、翻建、大修自住住房的；
8、（三）完全丧失劳动能力，并与单位终止劳动关系的；
9、（六）房租超出家庭工资收入的规定比例的。
10、依照前款第（二）、（三）、（四）项规定，提取职工住房公积金的，应当同时注销职工住房公积金账户。
11、职工死亡或者被宣告死亡的，职工的继承人、受遗赠人可以提取职工住房公积金账户内的存储余额；无继承人也无受遗赠人的，职工住房公积金账户内的存储余额纳入住房公积金的增值收益。
1、住房公积金是从员工工资里扣一部分，单位为员工缴存一部分。可以申请不缴纳住房公积金。国务院《住房公积金管理条例》规定，公积金缴纳基数是本人上年月平均工资，每月缴纳比例为5%-12%。企业根据实际情况规定缴纳比例。但最低不得低于5%，最高也不得高于12%。
2、住房公积金是指国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业及其他城镇企业、事业单位及其在职职工缴存的长期住房储金。住房公积金制度实际上是一种住房保障制度，是住房分配货币化的一种形式。住房公积金制度是国家法律规定的重要的住房社会保障制度，具有强制性、互助性、保障性。单位和职工个人必须依法履行缴存住房公积金的义务。职工个人缴存的住房公积金以及单位为其缴存的住房公积金，实行专户存储，归职工个人所有。
3、（一）使用住房公积金支付后期按揭贷款；
4、（二）使用住房公积金支付房租缓解租房压力；
5、（三）使用住房公积金用于房屋装修；
6、（四）使用住房公积金进行住房翻修或者重建；
7、（五）使用住房公积金支付重大疾病用于治疗以外减轻家庭负担。
8、第十八条职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%；有条件的城市，可以适当提高缴存比例。具体缴存比例由住房公积金管理委员会拟订，经本级人民政府审核后，报省、自治区、直辖市人民政府批准。
9、第十九条职工个人缴存的住房公积金，由所在单位每月从其工资中代扣代缴。单位应当于每月发放职工工资之日起5日内将单位缴存的和为职工代缴的住房公积金汇缴到住房公积金专户内，由受委托银行计入职工住房公积金账户。
10、第二十条单位应当按时、足额缴存住房公积金，不得逾期缴存或者少缴。对缴存住房公积金确有困难的单位，经本单位职工代表大会或者工会讨论通过，并经住房公积金管理中心审核，报住房公积金管理委员会批准后，可以降低缴存比例或者缓缴；待单位经济效益好转后，再提高缴存比例或者补缴缓缴。
11、第二十四条职工有下列情形之一的，可以提取职工住房公积金账户内的存储余额：
12、（一）购买、建造、翻建、大修自住住房的；
13、（三）完全丧失劳动能力，并与单位终止劳动关系的；
14、（六）房租超出家庭工资收入的规定比例的。
15、依照前款第（二）、（三）、（四）项规定，提取职工住房公积金的，应当同时注销职工住房公积金账户。职工死亡或者被宣告死亡的，职工的继承人、受遗赠人可以提取职工住房公积金账户内的存储余额；无继承人也无受遗赠人的，职工住房公积金账户内的存储余额纳入住房公积金的增值收益。